堆肥发酵过程中的有害气体主要包括氨气、氧化亚氮和二氧化碳等。这些气体的产生不仅会导致环境污染，还会造成堆肥产品的质量损失。以下是一些减少堆肥发酵过程中有害气体排放的方法：

1、改进堆肥设施：例如使用密闭的反应器或罐式堆肥设备，这样可以降低有害气体的释放。

2、添加调理剂：例如添加沸石粉和硝化抑制剂等，这些物质能对氨氮进行物理吸附，降低氮素损失，从而减少有害气体的排放。

3、优化堆肥发酵工艺：例如调整堆肥初期的曝气时间和堆肥末期的曝气量，可以降低堆肥周期总氮损失，但可能会增大堆肥过程中的有害气体排放。

4、选择合适的辅料：选择富含C的辅料与畜禽粪便联合堆肥，可以促进有机物降解，降低碳氮损失，其中以稻草或锯末为辅料时的温室气体排放量较低。

5、控制初始C/N：初始C/N对堆肥过程N损失影响较大，总氮、NH3和N2O的损失均随C/N的增加而降低。

6、控制含水率：初始含水率显著影响CH4和N2O的排放，其排放量随含水率的增加呈显著上升趋势。

7、控制通风速率：通风速率为0.1~0.3 L·kg-1·min-1时，CH4排放和总碳损失较低。

以上方法在实施过程中需要结合具体的堆肥发酵工艺和环境条件进行调整，以达到最佳的效果。