Основной принцип компостирования заключается в использовании широкого спектра микроорганизмов, таких как бактерии, актинобактерии и грибы, которые в определённых искусственных условиях контролируемо способствуют биохимическому процессу превращения органических веществ, поддающихся биологическому разложению, в стабильный азотистый материал. Этот процесс включает следующие основные этапы:

1. Дыхание и метаболизм органического углерода: в процессе компостирования органический углерод подвергается дыханию и метаболизму микроорганизмами, в результате чего содержание органического углерода снижается.

2. Выделение тепла: при дыхании и метаболизме органического углерода образуется тепло, что позволяет температура компостирования достигать более 70 °C. Это в определённой степени способствует уничтожению микробов и инсектицидным действиям на яйца насекомых.

3. Азотизация: микроорганизмы в ходе своей жизнедеятельности окисляют часть поглощённого органического вещества до простых неорганических соединений, выделяя энергию, необходимую для роста и активности микроорганизмов, а другую часть органического вещества преобразуют и синтезируют в новые клеточные вещества, обеспечивая рост и размножение микроорганизмов и формирование большего количества живых организмов.

4. Безвредность: органические отходы после укладки минерализуются и азотизируются, при этом высокая температура (60–70 °C), образующаяся в процессе укладки, уничтожает болезнетворные микроорганизмы, яйца насекомых и семена сорняков, достигая цели безвредности.

Кроме того, в процессе компостирования растворимые органические вещества из органических отходов поглощаются микроорганизмами через клеточные стенки и мембраны; твёрдые и коллоидные органические вещества сначала оседают на поверхности микроорганизмов, затем под действием экзосферных ферментов, вырабатываемых микроорганизмами, разлагаются на растворимые вещества, которые проникают внутрь клеток. Микроорганизмы благодаря своей жизненной деятельности окисляют часть поглощённых органических веществ до простых неорганических форм, высвобождают энергию, необходимую для жизнедеятельности, а также преобразуют часть органических веществ в питательные вещества, необходимые живым организмам, для синтеза новых клеточных веществ. Таким образом, органические отходы минерализуются и азотизируются, при этом высокая температура (60–70 °C), образующаяся при укладке, уничтожает болезнетворные микроорганизмы, яйца насекомых и семена сорняков, достигая цели безвредности.

Следует отметить, что процесс компостирования — это не однократное явление, а циклический процесс, включающий низкотемпературную, среднетемпературную, высокотемпературную и охлаждающую стадии. На каждом этапе различные микроорганизмы играют свою роль, используя органические вещества из отходов в качестве источника пищи и энергии, пока не будет сформирован стабильный азотистый продукт.